بدیهی است هر مؤسسه پژوهشی در راستای امر تحقیق خود نیاز به متون پژوهشی دارد. پس نمی‌توان واحد کتابخانه را در این‌گونه مراکز نادیده گرفت، لذا این مرکز برای امور جاری تحقیقاتی خود اقدام به تأسیس کتابخانه‌ای با ظرفیت سی‌هزار جلد کتاب نموده است، که هم‌اکنون بیش از نیمی از ظرفیت آن تکمیل گشته و دارای کتاب‌های بسیار غنی در زمینه علوم قرآنی، تفسیر، حدیث، فقه، ادبیات، روانشناسی، علوم تربیتی، مباحث خانواده، نسخه‌شناسی، ترجمه، ادیان و دیگر موضوعات بالغ بر 13 هزار عنوان می‌باشد که علاوه بر استفاده محققین این مرکز، مورد استفاده پژوهشگران حوزه و دانشگاه در سطح استان نیز قرار می‌گیرد.